ADN ligasa (ATP, ADP o GTP) EC #: 6.5.1.7

Nombre del producto ADN ligasa (ATP, ADP o GTP)
Estructura de ejemplo Estructura de ejemplo de ADN ligasa (ATP, ADP o GTP) EC #: 6.5.1.7
Sinónimos ADN ligasa Hbu, ADN ligasa dependiente de cofactores múltiples, ADN ligasa Szi
Número EC 6.5.1.7
Número de registro CAS
Comentarios Las enzimas de las arqueas? Hyperthermus butylicus? Y? Sulfophobococcus zilligii? Son activas con ATP, ADP o GTP. No muestran actividad con NAD +. La enzima cataliza la unión de las cadenas de ADN con los extremos 3'-hidroxilo y 5'-fosfato, formando un fosfodiéster y sellando ciertos tipos de roturas de una sola cadena en el ADN dúplex. La catálisis se produce mediante un mecanismo de tres pasos, que comienza con la activación de la enzima por ATP, ADP o GTP, formando un enlace fosforamida entre adenilato / guanilato y un residuo de lisina. A continuación, el nucleótido se transfiere al extremo 5'-fosfato del sustrato, formando la estructura cubierta 5 '- (5'-difosfoadenosina / guanosina) - [ADN]. Finalmente, la enzima cataliza un ataque nucleofílico del extremo 3'-OH en el extremo protegido, que da como resultado la formación del enlace fosfodiéster y la liberación del nucleótido. A diferencia de EC \ Delta 6.5.1.1, ADN ligasa (ATP), y EC \ Delta 6.5.1.6, ADN ligasa (ATP o NAD +), que no puede utilizar GTP.
Cofactor
Historia
Reacciones (1) Atp + (desoxirribonucleótido) (n) -3'-hidroxilo + 5'-fosfo- (desoxirribonucleótido) (m) = (desoxirribonucleótido) (n + m) + Amp + difosfato. (2) Adp + (desoxirribonucleótido) (n) -3'-hidroxilo + 5'-fosfo- (desoxirribonucleótido) (m) = (desoxirribonucleótido) (n + m) + Amp + fosfato. (3) Gtp + (desoxirribonucleótido) (n) -3'-hidroxilo + 5'-fosfo- (desoxirribonucleótido) (m) = (desoxirribonucleótido) (n + m) + Gmp + difosfato.

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